Маукхари, возможно, были кшатриями. Они играли важную роль в истории Северной Индии после падения империи Гупта. Династия делилась на несколько ветвей. Наиболее значительная ветвь правила в долине Ганга и обычно связывается с Канауджем. Вторая ветвь правила в районе Гайя, в Бихаре. Третья оставила о себе сведения в княжестве Кота, в Раджастхане.
Первым значительным членом канауджской ветви дома Маукхари был Ишанаварман (около 554 г. и. э.), который претендовал на победы над андхрами, силиками (кем они являлись, точно не установлено) и гаудами; он присвоил себе титул властителя империи. Во время его правления началась длительная борьба между Маукхари и Гуптами, которая окончилась только с падением власти Маукхари в начале VII века. Прабхакаравардхаи из Тханешвара был сначала союзником Гупта, но к концу своего правления он отдал свою дочь Раджьяшри замуж за Грахавармана, маукхарского князя. Этот союз между Тханешваром и Канауджем вынудил Девагупту, современного ему гуптского правителя Мальвы, заключить союз сШашанкой, вождем племени гауда. После смерти Прабха-каравардхана Девагупта ишашанка, невидимому, совершили совместное нападение на государство Маукхари, окончившееся разрушением последнего.